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手把手教你使用TCGA下載臨床數據

欄目:最新研究動態 發布時間:2021-01-20
如何下載臨床數據?相信這個問題一定困擾過做科研的你,下面跟小編一起來Get這個技能吧!

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1. 打開瀏覽器搜索“TCGA GDC



2. 鼠標放置在 Repository”處就會看到出現“browse and download data”字樣,說明轉錄組數據是在這里下載的 


3. 進入“Repository”后先看右上角“Cart”處是否為“0”,不為零的話要先清除之前下載的數據,清除方法是選擇“Cart”,然后點擊右下角的“Remove From Cart”。

 

4. Cart”里面的內容清除之后,點擊“Repository”,開始選擇需要下載的樣品信息“Cases”和需要下載的文件“Files”。

 

5. 這里我們以結腸癌COAD和直腸癌READ為例,下載臨床信息,首先選擇樣品信息“Cases”,我們這里選擇的結腸癌COAD和直腸癌READ的所有信息,如果需要下載針對性的臨床信息(這里我們選擇結腸癌COAD和直腸癌READ的數據進行下載)可以在下拉框中自行選擇





6. 然后選擇需要下載的文件“Files”,這里也可以再下拉框中根據自己需要的格式進行下載

 

7. 然后將文件添加到“Cart, 即點擊“Add All Files to Cart

 

8. 總共篩選出548個結腸癌和直腸癌臨床數據的樣本信息,進入“Cart”頁面,選擇要下載的格式進行下載

 

這樣我們的臨床數據的樣本信息就下載完成了,小伙伴們如果想要學習其他數據庫的使用,請持續關注呦!