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一種新型LncRNA HITT與HIF-1α形成調節環,以調節血管生成和腫瘤生長

欄目:最新研究動態 發布時間:2020-02-27
越來越多的證據表明,長的非編碼RNA(lncRNA)在包括癌癥在內的人類疾病中發揮著重要作用......

導語:
   越來越多的證據表明,長的非編碼RNA(lncRNA)在包括癌癥在內的人類疾病中發揮著重要作用;但是,只有少數幾個經過了實驗驗證和功能注釋。在這里,將確定了一種新的lncRNA,稱為HITT(翻譯水平的HIF-1α抑制劑)。在多種人類癌癥中,HITT通常會降低。HITT是缺氧轉換后變化最大的lncRNA之一,這篇文章將拓寬我們對lncRNA的癌癥相關功能的理解,突出了lncRNA–HIF-1α軸在癌癥的靶向治療中所具有的潛在影響。
技術路線:
1、人類結腸組織樣本的獲取以及結腸細胞系的培養
2、證明LncRNA HITT在人類癌癥中普遍減少
3、HITT以HIF-1α依賴性方式抑制血管生成和腫瘤生長
4、驗證HITT抑制HIF-1α翻譯且HITT充當HIF-1α翻譯調節YB-1的誘餌
5、HIF-1α通過MiR-205介導的RNA降解
6、HIF-1α促進HITT的降解并通過反饋回路降低了HITT的穩定性
7、HITT下調與人類結腸癌組織中高水平的HIF-1α相關
研究結果:
1、LncRNA HITT通常在人類癌癥中減少

   快速擴增3'-和5'-互補DNA末端分析證實HITT是具有聚腺苷酸化的20-50nt轉錄本位點。 HITT的編碼電勢值為0.387,在細胞核和細胞質中都檢測到了可比的HITT量。值得注意的是,HITT在分析的結腸癌組織中顯著下調。TCGA數據庫的分析顯示,HITT在多種癌癥類型中被下調。HITT通過以HIF-1α依賴性方式抑制血管生成來防止體內腫瘤生長。在HCT116異種移植物中分別通過WB和qRT-PCR測量HIF-1α和VEGF蛋白和VEGF mRNA水平。這些發現共同表明HITT在人類癌癥中通常被下調。


2、HITT以HIF-1α依賴性方式抑制血管生成和腫瘤生長
   HITT可能通過拮抗有害的微環境因素來抑制腫瘤的生長。使用特異性靶向HIF-1α的siRNA抑制了HIF-1α的表達。HITT表達或HIF-1αKD降低了Ki-67的強度和血管密度。VEGF是已知的HIF-1α下游促血管生成靶標被HITT抑制。使用體外模型驗證了HITT對HIF-1α誘導的血管生成的影響。HIF-1αKD還消除了低氧誘導的VEGF表達和HUVEC分支,有趣的是,完全消除了HITT的抗血管生成作用。相反,HIF-1α的過表達可以挽救HITT抑制的HUVEC分支。總的來說,該發現表明HITT通過干擾HIF-1α依賴性信號來抑制血管生成和腫瘤生長。


3、HITT抑制HIF-1α的表達和活性
   HITT明顯降低了缺氧誘導的HIF-1α表達約5至6倍,而HITT KD在常氧下增加了HIF-1α。HITT持續抑制HIF-1αmRNA表達約兩倍,而HITT KD促進它的表達。表明HITT主要在蛋白質水平上調節HIF-1α并且HITT對HIF-1α的抑制作用可能是特異性的。更重要的是,缺氧顯著增加了HIF-1α的轉錄活性,并且在穩定的HITT表達細胞系中這種作用被消除,而異位HIF-1α表達抑制了HITT的作用。另外,低氧增加了成熟的HIF-1α靶標的表達,例如VEGF和血管生成素-1,而HITT顯著減弱了它的表達。這些數據共同說明,HITT主要通過調節其HIF-1α的蛋白水平來抑制其轉錄活性。


4、HITT抑制HIF-1α翻譯
   在HITT轉染的穩定系和對照系中用蛋白合成抑制劑CHX處理細胞后,HIF-1α以相似的速率衰減。與多核糖體相關的HIF-1αmRNA隨缺氧而增加,重要的是,異位HITT表達損害了缺氧誘導的HIF-1αmRNA與多核糖體的結合,而HITT KD增加了它們的結合。相反,GAPDH mRNA的分布均保持不變。HITT的過表達抑制了新合成的HIF-1α蛋白,而HITT KD在缺氧條件下使其表達增加。新合成的α-微管蛋白用作陰性對照,并且未被異位HITT表達或KD改變。因此,HITT抑制HIF-1αmRNA的翻譯。


5、HITT充當HIF-1α翻譯調節YB-1的誘餌
   HITT對HCT116裸鼠異種移植物的體外和體內YB-1蛋白表達均無明顯影響,但HITT中預測了8個YB-1結合序列。 YB-1 KD降低了HIF-1α水平,而HITT失去了影響YB-1 KD細胞中HIF-1α表達的能力。HITT的富集顯著降低,而5'-UTR的富集響應于低氧開關而增加。在缺氧條件下并同時廢除了HIF-1α 5'-UTR與YB-1的缺氧促進的關聯。含有預測的YB-1結合基序的HITT有助于其與YB-1結合。表明HITT介導的HIF-1α抑制需要YB-1的結合。此外,YB-1 KD和異位HITT表達均阻止了低氧誘導的WTHIF-1α-5'-UTR-螢光素酶報道基因的活性,說明HITT直接與YB-1結合并阻止其與HIF-1α5'-UTR締合,從而導致HIF-1α翻譯減少。



6、HIF-1α通過反饋回路降低了HITT的穩定性
   在低氧條件下,HITT顯著降低。si-HIF-1α降低了HIF-1α的水平,同時恢復了HITT的表達。相反,異位HIF-1α表達降低了HITT。HIF-2α對HITT的表達沒有任何明顯的影響,表明HITT受HIF-1α通過反饋回路的調控。在HITT的啟動子中沒有發現HRE基序,異位HIF-1α的表達和KD都不會對HITT啟動子驅動的熒光素酶活性產生顯著影響。缺氧會降低HITT的半衰期,而不降低GAPDH mRNA的半衰期。HIF-1αKD阻斷了缺氧的影響。在缺氧和缺氧的情況下,HIF-1α缺乏的786-O細胞中檢測到的HITT水平相當。這些數據表明,HIF-1α決定了HITT的穩定性。


7、HIF-1α通過MiR-205介導的RNA降解促進HITT的降解
   HITT是MiR-205的候選靶標。通過qRT-PCR驗證MiR-205可能介導HIF-1α誘導的下游分子,MiR-205抑制劑預防了低氧誘導的MiR-205,并且還恢復了低氧條件下降低的HITT水平,而在常氧條件下通過轉染MiR-205模擬物誘導的MiR-205顯著降低了HITT。 MiR-205模擬物還消除了缺氧條件下HIF-1αKD誘導的HITT恢復。此外,缺氧降低了WT HITT熒光素酶報道基因的活性。通過下拉生物素化的前體MiR-205和qRT-PCR,證實了MiR-205和HITT之間的直接締合。Ago2的KD是RNA誘導的沉默復合物/ MiR-205的重要組成部分。 RIP Ago2顯示HITT與Ago2相關。這些數據構建了一個模型, Ago2 / miR-205在生理上與HITT結合,從而促進了MiR-205介導的HITT降解。


8、HITT下調與人類結腸癌組織中高水平的HIF-1α相關
   發現了新穎的HITT–HIF-1α軸后,驗證了HIF-1α與HITT在人類癌癥組織中的表達之間的相關性。 在人結腸癌組織和匹配的對照中檢測了HIF-1α及其靶標VEGF的蛋白水平(n = 46)。與匹配的正常對照相比,結腸癌組織中的HIF-1α和VEGF蛋白水平通常升高。降低的HITT水平與增加的HIF-1α蛋白和VEGF mRNA表達密切相關。這些發現與體外和異種移植數據相結合,證明HITT在翻譯水平上調節HIF-1α,這導致HIF-1α及其靶標的表達降低。

總結:
   癌細胞中HITT表達的恢復以HIF-1α依賴性方式抑制體內的血管生成和腫瘤生長。研究表明HITT主要通過干擾其翻譯來抑制HIF-1α的表達。HITT通過高嚴格的YB-1結合基序從HIF-1αmRNA的5'- UTR滴定YB-1。HITT和HIF-1α表達之間的反向相關性在人結腸癌組織中得到進一步證實。此外,缺氧誘導的HIF-1α表達需要HITT下調。進一步證明HITT和HIF-1α形成了一個自動調節反饋回路,其中HIF-1α通過誘導直接靶向HITT降解的MiR-205破壞了HITT的穩定性。突出了HITT–HIF-1α軸構成了另一層血管生成和腫瘤生長的調節層,對治療靶向具有潛在的影響。
   綜上所述,我們已經鑒定出HITT,一種新型的lncRNA。我們的數據強調了新發現的HITT–HIF-1α軸在調節血管生成和腫瘤生長中的重要性。HITT介導的HIF-1α合成的分子機制的詳細剖析提供了通過恢復HITT活性抑制HIF-1α的新策略的見解。