国产喷水吹潮视频在线播放_日本黄漫动漫免费播放_天天做人人爱夜夜爽2020_久久作爱视频

LncRNA助力結(jié)直腸癌研究

欄目:最新研究動(dòng)態(tài) 發(fā)布時(shí)間:2019-12-26
結(jié)直腸癌(CRC)很恐怖,科研工作者責(zé)任重大。小小lncRNA顯神通,助力CRC研究義不容辭......

導(dǎo)語:結(jié)直腸癌(CRC)很恐怖,科研工作者責(zé)任重大。小小lncRNA顯神通,助力CRC研究義不容辭。今天,小編就帶大家一睹其風(fēng)采。


思維脈絡(luò):


結(jié)果:
1. 結(jié)直腸組織特異性lncRNA SATB2-AS1在CRC組織中下調(diào)

SATB2-AS1在結(jié)腸癌組織和細(xì)胞中均顯著降低。分析ASTB2-AS1表達(dá)與CRC臨床病理的關(guān)系,SATB2-AS1的表達(dá)與腫瘤浸潤(rùn)深度、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、TNM階段相關(guān),生存分析顯示較低的SATB2-AS1水平與不良的整體生存和不良的無復(fù)發(fā)生存相關(guān)。


2.SATB2-AS1抑制CRC轉(zhuǎn)移,其表達(dá)與腫瘤內(nèi)免疫細(xì)胞豐度相關(guān)
   使用CRC轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行基因富集分析顯示HALLMARK_EPITHELIAL_MESENCHYMAL_TRANSITION,HALLMARK_INFLAMMATORY_RESPONSE,HALLMARK_COMPLEMENT,HALLMARK_INTERFERON_GAMMA _RESPONSE和HALLMARK_INTERFERON_ALPHA_RESPONSE的基因簽名富集在SATB2-AS1低表達(dá)患者中。敲低SATB2-AS1增加CRC細(xì)胞的遷移和侵襲能力。小鼠肺轉(zhuǎn)移模型顯示沉默SATB2-AS1促進(jìn)了肺轉(zhuǎn)移。沉默SATB2-AS1降低E-鈣粘蛋白表達(dá)和增加Vimentin表達(dá),轉(zhuǎn)移相關(guān)蛋白MMP9上調(diào)表達(dá)。SATB2-AS1的表達(dá)與多種免疫反應(yīng)相關(guān)。基于組織中免疫細(xì)胞浸潤(rùn)的數(shù)量,將CRC樣本分為“高滲透”組和“低滲透”組。發(fā)現(xiàn) “高滲透”組中大多數(shù)樣品SATB2-AS1的表達(dá)低于所有樣本的中等水平,樣本分布具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。發(fā)現(xiàn)TH1型趨化因子CXCL9和CXCL10SATB2-AS1敲低的CRC細(xì)胞表達(dá)升高。


3.SATB2-AS1通過調(diào)節(jié)SATB2發(fā)揮其生物學(xué)作用
   沉默SATB2-AS1會(huì)明顯減少同源基因SATB2的蛋白和RNA水平。CRC組織SATB2表達(dá)顯著減少,生存分析表明SATB2低表達(dá)與較短的總體生存率和無復(fù)發(fā)生存率密切相關(guān)。相關(guān)性分析表明CRC組織中SATB2-AS1表達(dá)與SATB2顯著正相關(guān)。SATB2過表達(dá)抑制癌細(xì)胞的遷移侵襲能力, SATB2過表達(dá)細(xì)胞中的SATB2-AS1敲除可部分減輕抑制。小鼠接種過表達(dá)SATB2的HCT-116細(xì)胞較長(zhǎng)總體存活時(shí)間、較低的轉(zhuǎn)移率和肺部轉(zhuǎn)移灶較少,沉默SATB2-AS1可部分恢復(fù)被SATB2過表達(dá)抑制的轉(zhuǎn)移能力。SATB2可部分削弱過表達(dá)SATB2的CRC細(xì)胞中E-cadherin的增加水平,Vimentin和MMP-9的減少可通過SATB2-AS1沉默部分挽救。SATB2-AS1表達(dá)低的患者顯示較低的SATB2和E-cadherin表達(dá)以及較高的Vimentin表達(dá),SATB2-AS1表達(dá)水平與SATB2和E-cadherin呈正相關(guān)與Vimentin表達(dá)負(fù)相關(guān)。SATB2過表達(dá)抑制CXCL9和CXCL10在CRC細(xì)胞中的表達(dá),SATB2-AS1敲低可部分緩解由SATB2引起的CXCL9和CXCL10的降低。


4.SATB2-AS1直接綁定到WDR5和GADD45A,CRC中SATB2的低表達(dá)是由于啟動(dòng)子區(qū)的高DNA甲基化和組蛋白H3K4me3損失引起的
   SATB2-AS1主要在細(xì)胞核中表達(dá),用生物素化的SATB2-AS1拉出WDR5(組蛋白H3K4甲基轉(zhuǎn)移酶復(fù)合物)和DNA去甲基化的調(diào)節(jié)劑GADD45A,構(gòu)建SATB2-AS1的五個(gè)片段驗(yàn)證WDR5和GADD45A的SATB2-AS1相互作用區(qū)域,結(jié)果顯示SATB2-AS1的3'片段介導(dǎo)了其與WDR5和GADD45A的相互作用。CRC組織R3和R4區(qū)域的DNA甲基化程度更高,H3K4me3在SATB2啟動(dòng)子中的富集在CRC細(xì)胞中顯著低于正常細(xì)胞。


5.SATB2-AS1通過募集WDR5和GADD45A蛋白調(diào)節(jié)SATB2啟動(dòng)子的DNA去甲基化和H3K4me3富集
   SATB2-AS1可以生理結(jié)合具有SATB2的啟動(dòng)子序列,ChIP-PCR結(jié)果顯示HCT-116細(xì)胞(C1,C2,C3,C5,C8位點(diǎn))和HCT-8細(xì)胞(C1,C2,C3,C6,C7,C8,C9位點(diǎn))的SATB2啟動(dòng)子區(qū)域中H3K4me3的富集水平在SATB2-AS1敲低后顯著下降。BSP實(shí)驗(yàn)表明CRC細(xì)胞的SATB2啟動(dòng)子區(qū)域中的DNA甲基化水平在敲低SATB2-AS1后顯著增加。上皮標(biāo)志物E-cadherin也在WDR5-或GADD45A過表達(dá)CRC細(xì)胞中上調(diào),它的上調(diào)可以SATB2-AS1沉默被廢除。VimentinWDR5或GADD45A過表達(dá)的CRC細(xì)胞表達(dá)降低,其減少可由SATB2-AS1沉默所挽救。